南區國稅局表示，依加值型及非加值型營業稅法規定，在中華民國境內銷售貨物或勞務者，應依法課徵營業稅。另依同法規定藥師、藥劑生提供之專業性勞務非屬營業稅課稅範圍。對於藥師、藥劑生親自主持的藥局，是否需課徵營業稅及開立發票的相關規定分述如下：

1.藥局如專營藥品調劑、供應業務，未兼營藥品或其他貨物銷售業務者，免辦營業登記，免課徵營業稅；惟應按其收入核定主持藥師、藥劑生的執行業務所得，依法課徵綜合所得稅。

2.藥局除經營藥品調劑、供應業務外，如兼營藥品或其他貨物銷售業務者，應依法辦理營業登記，屬於經營藥品調劑、供應業務的收入，應核定主持藥師、藥劑生的執行業務所得，依法課徵綜合所得稅；屬於銷售藥品或其他貨物的收入，應依法課徵營業稅，如每月營業額超過新臺幣20萬元，則需開立統一發票。

3.藥局專營或兼營藥品調劑、供應業務，依前開規定免徵營業稅者，應保存醫師處方箋及帳載等相關證明文件與資料，以供稽徵機關查核，否則，仍應依法課徵營業稅。

該局呼籲業者，自行檢視本身屬何種經營型態，如有非屬藥品調劑、供應業務者，除應依法辦理營業登記外，尚需依相關規定報繳營業稅，以免日後遭查獲，除補稅外並處罰鍰。

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